科技日?qǐng)?bào)訊 在日常生活中,,全球定位系統(tǒng)(GPS)能可靠定位一輛車(chē)在行駛途中的即時(shí)位置,。最近,德國(guó)波恩大學(xué)科學(xué)家開(kāi)發(fā)出一種分子“GPS”,,用這種“分子定位系統(tǒng)”能可靠確定金屬離子在酶里面的位置,,這些離子在新陳代謝和生物產(chǎn)品合成中都扮演著重要角色。相關(guān)論文發(fā)表在最近的《應(yīng)用化學(xué)》雜志上,。 如果沒(méi)有酶,,地球上也不會(huì)有生命。這些酶分子控制著各種生化反應(yīng),,從食物消化到遺傳信息復(fù)制,。“酶的空間結(jié)構(gòu)很復(fù)雜,,有著多重折疊,,許多層和許多彎曲?!辈ǘ鞔髮W(xué)物理與理論化學(xué)研究所教授奧拉夫·希曼說(shuō),。 而這種“蛋白質(zhì)結(jié)”的反應(yīng)中心叫做“活性中心”,通常有一種或多種金屬離子,。在化學(xué)反應(yīng)中,,物質(zhì)會(huì)附著或接近金屬離子,,離子幫助破壞和重建分子鍵,,由此將一種物質(zhì)轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N新物質(zhì)。比如在人們胃里,,就不斷地發(fā)生著這種轉(zhuǎn)變,,食物被分解成身體容易吸收的物質(zhì)。 為了研究這些酶是怎樣運(yùn)作的,,科學(xué)家需要精確掌握單個(gè)原子在這些生物分子中是怎樣排列的,。“只要我們知道酶里面的金屬離子在什么地方,,就能精確掌握反應(yīng)進(jìn)程,。”希曼說(shuō),。他的研究小組利用一種與GPS(全球定位系統(tǒng))原理極為類(lèi)似的新方法,,確定了一種酶的活性中心的位置,。 “酶的結(jié)構(gòu)復(fù)雜重復(fù),就像交通高峰時(shí)的高速迷宮,?!毖芯咳藛T解釋說(shuō),要在繁忙的高速路上定位一輛車(chē)幾乎是不可能的,,金屬離子就像高速路上的車(chē),,“隱藏”在酶的重重纏繞和折疊中。就像GPS能定位某輛車(chē)的位置,,分子GPS也能定位金屬離子的位置,。 “我們的‘衛(wèi)星’是自旋標(biāo)記?!毖芯可诩{爾·阿布杜林說(shuō),,這是一些小的有機(jī)分子,有不成對(duì)電子而且很穩(wěn)定,。他們把6個(gè)這種“分子衛(wèi)星”散布到天青蛋白(azurine,,中心有銅離子的藍(lán)色蛋白)酶模型中,首次通過(guò)計(jì)算機(jī)程序跟蹤了這些微小“衛(wèi)星”在纏繞的酶中的“軌道”,。他們用一種叫做PELDOR的分光計(jì)確定了各個(gè)“衛(wèi)星”和金屬離子之間的距離,。“就像GPS那樣,,我們能精確定位酶里面活性中心的位置,。”阿布杜林說(shuō),。 “我們開(kāi)發(fā)了用于基礎(chǔ)研究的方法,,還能用它來(lái)弄清其它酶的結(jié)構(gòu)?!毕Bf(shuō),。更好地理解活性中心的物質(zhì)轉(zhuǎn)變,最終也是工業(yè)制藥的基礎(chǔ),。(常麗君) |
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