水污染物總量控制方面,，各設區(qū)市均已完成COD年度減排任務,，完成較好的是泉州市、龍巖市,，完成較差的是寧德市,、三明市,。

按照重點整治任務來看，飲用水源保護工作方面，基本完成“閩江,、九龍江水環(huán)境整治與水源保護”辦實事項目任務240項,，但永安尼葛工業(yè)園污水處理，龍巖,、南平市垃圾焚燒發(fā)電等項目建設滯后,；廈門汀溪水庫、漳州一水廠,、莆田東圳水庫,、南平安豐水廠、安溪城關水廠等水源保護區(qū)內仍存在生產(chǎn)性和經(jīng)營性排污單位,。

養(yǎng)殖業(yè)污染整治方面,，漳州、龍巖等市完成較好,；福州,、三明,、南平完成較差,；閩侯、尤溪,、延平禁養(yǎng)區(qū)還存在多家規(guī)?；B(yǎng)殖場，延平區(qū)還存在養(yǎng)殖業(yè)廢水跨界污染沙縣青州鎮(zhèn)飲用水源地等多項問題,，被掛牌督辦,。