四一二政變后,1927年5月21日,,長沙發(fā)生馬日事變。他不顧危險,,經長沙前往上海,為黨創(chuàng)辦地下印刷廠,,堅持秘密斗爭,。1928年6月赴莫斯科出席中共六大。9月進入莫斯科中山大學,,與徐特立,、吳玉章、董必武,、林伯渠等編在特別班學習,。1930年7月從蘇聯學習回國后,在上海負責全國互濟會工作,,組織營救被捕同志,,將暴露身份的同志轉往蘇區(qū)。
1931年11月,他奉命進入中央革命根據地,,與毛澤東等參加中央工農民主政府的領導工作,。當選為中華蘇維埃共和國中央執(zhí)行委員會委員,任臨時中央政府工農檢察人民委員,、內務人民委員部代部長,、臨時最高法庭主席等職。毛澤東高度評價他的革命精神和工作能力,,說“叔翁辦事,,可當大局”。在中央蘇區(qū),,他主持中央臨時政府檢察,、內務和最高法庭工作時,事無巨細,,均審慎細致,,實事求是,注重調查研究,,對工作嚴肅認真,,一絲不茍。他白天和群眾在田間地頭邊干活邊交談,,晚上召集干部群眾座談,,了解掌握了大量的第一手材料,發(fā)現有相當一部分干部,,靠行政命令去推行工作,,有的甚至貪污腐化,如不及時克服,,將直接威脅蘇維埃政權的鞏固,。隨即向毛澤東、項英等中央政府領導匯報,,以求及時解決問題,。他的審慎作風和務實態(tài)度,遭到“左”傾領導者的錯誤打擊,。但他始終以一個共產黨員的黨性原則嚴格要求自己,,堅持從大局出發(fā),忍辱負重,,努力做好組織分配給自己的工作,。
1934年10月,中央紅軍主力長征后,,何叔衡奉命留在中央革命根據地堅持游擊戰(zhàn)爭,,經受了嚴峻的生死考驗。1935年2月24日,從江西轉移福建途中,,在長汀突圍戰(zhàn)斗時壯烈犧牲,,實踐了“我要為蘇維埃流盡最后一滴血”的誓言,時年59歲,。1937年在延安紀念中國共產黨成立16周年大會上,,毛澤東在為犧牲同志默哀的名單中念到何叔衡的名字時,大家莫不為這位黨內的革命長者的犧牲而深感悲痛,。