這是5月30日德國羅伯特?科赫研究所提供的腸出血性大腸桿菌的電子顯微鏡照片。新華社/法新
新華網(wǎng)柏林6月2日電(記者班瑋)中國深圳華大基因研究院和德國漢堡-埃彭多夫大學(xué)醫(yī)學(xué)院2日宣布,,由中德科學(xué)家聯(lián)合進(jìn)行基因研究結(jié)果顯示,導(dǎo)致近期德國腸道病感染疫情的是由一種新的兼具侵襲,、產(chǎn)毒、腸出血等特征的大腸桿菌。
深圳華大基因研究院發(fā)表的新聞公報說,在一項由該研究院,、德國漢堡-埃彭多夫大學(xué)醫(yī)學(xué)院、中國疾病預(yù)防與控制中心和軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院微生物流行病研究所聯(lián)合進(jìn)行的研究中,,研究人員利用第三代測序儀“Ion Torrent”對在德國流行的病菌進(jìn)行了全基因組測序,,并通過對序列的分析發(fā)現(xiàn)該菌株屬于血清型O104大腸桿菌。但是,,O104型大腸桿菌以前未見引起人類大規(guī)模感染的報道,。研究人員通過進(jìn)一步比對分析發(fā)現(xiàn)該菌株與2002年從中非艾滋病患者腹瀉標(biāo)本中分離的腸聚集性大腸桿菌55989菌株的同源性超過93%,。對基因序列的分析結(jié)果顯示,,導(dǎo)致德國疫情的菌株通過基因水平轉(zhuǎn)移獲得了腸出血性大腸桿菌的毒力基因和毒力相關(guān)質(zhì)粒,這可能與該菌株強(qiáng)毒性和重癥感染有關(guān),。
研究還發(fā)現(xiàn),,該菌株攜帶氨基糖甙類、大環(huán)內(nèi)酯類,、磺胺類等抗生素的耐藥基因,,導(dǎo)致抗生素治療無效。
中國科學(xué)家還將進(jìn)一步分析這些毒力相關(guān)基因的完整性和表達(dá)情況以及耐藥和毒力基因水平轉(zhuǎn)移機(jī)制,,并在更多德國流行菌株中進(jìn)行驗證,。
漢堡-埃彭多夫大學(xué)醫(yī)學(xué)院細(xì)菌專家羅德2日說,,這項德中聯(lián)合研究在德國流行的致病菌中發(fā)現(xiàn)了兩種完全不同的細(xì)菌的部分基因。這一新組合有利于病菌在腸細(xì)胞上附著,,從而使其能在腸道內(nèi)宿居更長時間,,造成更大的破壞。此外,,這種病菌還對抗生素具有很強(qiáng)的抗藥性,。羅德稱這種新型病菌“是常見的腸出血性大腸桿菌的一個非常遠(yuǎn)的遠(yuǎn)親”。
據(jù)中國深圳華大基因研究院介紹,,德國大腸桿菌疫情發(fā)生后,,該研究院立即與德方研究機(jī)構(gòu)建立聯(lián)系開展合作,并成立專門研究小組對該細(xì)菌進(jìn)行測序和生物信息學(xué)分析,。在獲得病菌樣本后3天的時間內(nèi),,華大基因就完成了對這種新型大腸桿菌的基因組測序。
在過去3周多時間內(nèi),,腸出血性大腸桿菌疫情已在德國造成約2000例確診或疑似病例,,至少18人死亡。